Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm3543D3Z235 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm3543D3Z235 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm3543D3Z235 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm3543D3Z235 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm3543D3Z235 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm3543D3Z235 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3543D3Z235 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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