Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms