Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms