Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rtl10D3YWW5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms