Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms