Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms