Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms