Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11cB4XVP9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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