Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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