Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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