Protein–RNA interactions for Protein: B1AXH1

Nhsl2, NHS-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl2B1AXH1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhsl2B1AXH1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl2B1AXH1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms