Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NhsB1AV60 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NhsB1AV60 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NhsB1AV60 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NhsB1AV60 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms