Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap221A9Q751 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap221A9Q751 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms