Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Atp8b5A3FIN4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Atp8b5A3FIN4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Atp8b5A3FIN4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Atp8b5A3FIN4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Atp8b5A3FIN4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Atp8b5A3FIN4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
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Atp8b5A3FIN4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Atp8b5A3FIN4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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