Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms