Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col9a3A2ACT7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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