Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms