Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms