Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vmn2r25W4VSP2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms