Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3550W4VSN7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms