Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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