Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgr5Q9Z1P4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms