Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms