Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Snx1Q9WV80 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms