Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn4Q9WU22 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms