Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms