Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Six6Q9QZ28 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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