Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RhoaQ9QUI0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms