Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap3b2Q9JME5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms