Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp1Q9JLK7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms