Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms