Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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