Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nectin1Q9JKF6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin1Q9JKF6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms