Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms