Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Zfhx4Q9JJN2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zfhx4Q9JJN2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms