Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms