Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc12a4Q9JIS8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms