Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms