Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod3Q9JHJ0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tmod3Q9JHJ0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod3Q9JHJ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod3Q9JHJ0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tmod3Q9JHJ0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod3Q9JHJ0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod3Q9JHJ0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tmod3Q9JHJ0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod3Q9JHJ0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod3Q9JHJ0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmod3Q9JHJ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmod3Q9JHJ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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