Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms