Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn12Q9ER56 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms