Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Barx1Q9ER42 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms