Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms