Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sil1Q9EPK6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms