Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl4Q9DCU6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms