Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eif3fQ9DCH4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms