Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms