Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bpifa3Q9D9J8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bpifa3Q9D9J8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms