Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Alkbh4Q9D8F1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms