Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms